En 1953 est créé un nouveau certificat : celui de plongeur démineur et en 1958 la Compagnie de scaphandriers devient unité indépendante sous le nom d'École de plongée. Parallèlement, la formation des nageurs de combat est assurée à partir de 1953 par l'École des nageurs de combat (E.N.C.) d'Arsew qui est ensuite transférée au Centre d'application commando (C.A.C.) de Saint-Mandrier.

En 1960 l'École de plongée et le CAC sont regroupés sous le nom de "Centre d'Instruction et d'Entraînement à la Plongée" dont le sigle devient C.I.E.P.

En 1964 le certificat de plongeur démineur est converti en spécialité. 

Dans sa forme actuelle, l'École de plongée est créée par l'arrêté du 15 février 1965 qui dissout le C.I.E.P. Tous les plongeurs de bord, plongeurs démineurs et nageurs de combat y reçoivent leur formation. Tout d'abord comme dans le cadre de l'apprentissage des techniques de "plongée à l'air" dans le cadre du cours de plongeur, puis spécifiques en fonction de leur choix de certificat ou de spécialité.

De nos jours, l'École de plongée, École Interarmées, est chargée de former la totalité des plongeurs de la Marine nationale et des autres armées au sein de quatre cours principaux :

Le cours de plongeurs de bord : formation à la plongée à l'air jusqu'à 35 mètres de profondeur.

Le cours de plongeurs démineurs : formation aux techniques de déminage et à l'utilisation d'appareils de plongée spécifiques aux missions de guerre des mines.

Le cours de nageur de combat : formation aux techniques de plongée à l'oxygène et à l'utilisation d'appareils spécifiques aux missions à caractère offensif.

Le cours d'infirmiers hyperbaristes : formation médicale des infirmiers plongeurs à la surveillance des chantiers de plongée et aux traitements d'urgence des accidents de plongée.

L'École de plongée assure de plus :

• des stages de génie sous-marin (travaux subaquatiques).
• des stages de reconnaissance NEDEX (Neutralisation Enlèvement et Destruction d'Engins Explosifs).

Dans son cadre interarmées, l'École de plongée assure par ailleurs la formation des plongeurs de bord de la Gendarmerie Maritime et de l'armée de l'Air ainsi que la formation des nageurs de combat de l'armée de Terre. Elle accueille également chaque année une dizaine de stagiaires étrangers.

L'école prête également son concours en hommes et en matériels aux études et expérimentations menées par les commissions d'études pratiques dans le cadre de l'intervention sous la mer.

Dans le cadre de son ouverture vers l'extérieur, l'École de plongée organise des stages d'information, voire de formation,  en liaison avec l'Éducation nationale.

L'École de plongée a formé depuis sa création 10 000 plongeurs, dont 1800 sont encore actuellement en service dans la Marine. Chaque année, elle forme 450 stagiaires.